Bij harde schijven, kan ieder volume een andere bestandssysteem hebben. Het bestandssysteem wordt bepaalt wanneer het volume wordt ingedeeld. Het kan naderhand niet worden gewijzigd zonder het volume opnieuw in te delen.
Met de besturingssystemen van heden ten dage, zijn er veel verschillende bestandssystemen beschikbaar, elk met zijn eigen unieke zwakke en sterke kanten, &os2; kent de volgend bestandssystemen:
Heden ten dage is het enige voordeel van FAT dat het wordt gekend door bijna alle besturingssystemen, dus als u diverse besturingssystemen heeft ge‹nstalleerd, kunt u een FAT volume gebruiken voor het uitwisselen van gegevens. Als u ook snelheid belangrijk vindt, moet u geen veel gebruikte gegevens op FAT volumes plaatsen.
Met &os2;, is FAT ondersteuning direct in de kernel van &os2; ingebouwd en is geen IFS instelling in de &cfgsys; nodig.
In Windows95, heeft Microsoft het FAT bestandssysteem uitgebreid om het opslaan van lange bestandsnamen mogelijk te maken, ofschoon dit ook de andere begrenzingen van het FAT bestandssysteem niet oploste. In &os2; ziet u alleen 8+3 bstandsnamen.
Als toevoeging, met Windows 98 heeft Microsoft een nieuw bestandssysteem toegevoegd "FAT32" genaamd. Ondanks zijn naam, is het in het geheel niet uitwisselbaar met FAT. called "FAT32". Despite its name, this is not compatible with FAT at all. --> Er zijn oplossingen van derden die het mogelijk maken dat &os2; ook FAT32 volumes ziet via een IFS driver die aan het &cfgsys; bestand wordt toegevoegd.
Ofschoon vergeleken met zelfs meer moderne bestandssystemen heeft HPFS ook zijn beperkingen. Meest belangrijke, standaard HPFS kan alleen maar een buffer grootte tot 2 MB aan. Uitgaande van het geheugen dat in de tegenwoordige computers is ingebouwd, is dat niet veel.
Voor HPFS ondersteuning moet het
HPFS.IFS stuurprogramma, door een vermelding
in het &cfgsys; bestand geladen worden.
Echter dit bestandssysteem is alleen te verkrijgen tegen extra kosten.
Indien geinstalleerd, vervangt HPFS386 het standaard HPFS. Het wordt geladen
door het HPFS386.IFS stuurprogramma in de &cfgsys;, maar dat zal niet werken
als u de server componenten niet heeft geinstalleerd.
JFS heeft de volgende voordelen boven HPFS:
CHKDSK
uit te voeren om de integriteit van het bestandssysteem terug te zetten, maar kan
eenvoudig het 'journal' "afspelen" dat het heeft onderhouden.
Met als resultaat dat CHKDSK op een JFS volume seconden duurt i.p.v.
minuten of zelfs uren zoals met grote HPFS volumes.
JFS ondersteuning wordt mogelijk door het
JFS.IFS stuurprogramma
aan het &cfgsys; bestand toe te voegen.
CDFS.IFS stuurprogramma en wordt gebruikt
wanneer gegevens CD-ROM's worden benaderd. Het &os2; CDS stuurprogramma ondersteunt lange
bestandsnamen in de Microsoft Joliet indeling.